Sự khác biệt chính: SQL còn được gọi là cơ sở dữ liệu quan hệ và có cấu trúc hơn cơ sở dữ liệu NoQuery, được gọi là cơ sở dữ liệu không liên quan. Cơ sở dữ liệu phi quan hệ có xu hướng được định hướng và phân phối nhiều tài liệu hơn là có cấu trúc.
Cơ sở dữ liệu NoQuery thực sự có trước cơ sở dữ liệu SQL, vì chúng tồn tại từ những năm 1960, trong khi SQL không được phát triển cho đến năm 1974. Tất cả các cơ sở dữ liệu tồn tại trước sự phổ biến của SQL đều nằm dưới biệt danh NoQuery. SQL còn được gọi là cơ sở dữ liệu quan hệ và có cấu trúc hơn cơ sở dữ liệu NoQuery, được gọi là cơ sở dữ liệu không liên quan. Cơ sở dữ liệu phi quan hệ có xu hướng được định hướng và phân phối nhiều tài liệu hơn là có cấu trúc. Ví dụ, có thể nói rằng cơ sở dữ liệu quan hệ được cấu trúc như danh bạ điện thoại lưu trữ số điện thoại và địa chỉ, trong khi cơ sở dữ liệu không liên quan giống như các thư mục tệp chứa mọi thứ từ địa chỉ và số điện thoại của người dùng đến sở thích mua sắm trực tuyến của họ.